RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CYP26A1O43174 497 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CNGA1P29973 690 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CCND2P30279 289 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 FLT3P36888 993 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 IRAK1P51617 712 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 EPS8L1Q8TE68 723 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CEP170P1Q96L14 293 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 PLAAQ9Y263 795 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.33■■□□□ 1.33
C10orf55-201ENST00000409178 PFASO15067 1338 aa23.33■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 MAPK13O15264 365 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 RGS20O76081 388 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 IWS1Q96ST2 819 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SMTNP53814 917 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 HMGCS2P54868 508 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 TRIM51Q9BSJ1 452 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 ALG6Q9Y672 507 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.32■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 MARCKSL1P49006 195 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 REPS2Q8NFH8 660 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 KRT35Q92764 455 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 WRNIP1Q96S55 665 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 DPH5Q9H2P9 285 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 HSD17B3P37058 310 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 ATP1A2P50993 1020 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 GNGT1P63211 74 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 RHOT2Q8IXI1 618 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 PARD3BQ8TEW8 1205 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 GINM1Q9NU53 330 aa23.31■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 GRIN2DO15399 1336 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 STBD1O95210 358 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 MMEP08473 750 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 KCNA2P16389 499 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 PTPRAP18433 802 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 OR2W6PQ8NHA6 318 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 TAS1R2Q8TE23 839 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CARD9Q9H257 536 aa23.3■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 GPC5P78333 572 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 KRT39Q6A163 491 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CD302Q8IX05 232 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 GPRASP2Q96D09 838 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 PPFIA4O75335 1185 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CALCAP01258 141 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 TGFB2P61812 414 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 HELQQ8TDG4 1101 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 BTBD6Q96KE9 485 aa23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 PMM2O15305 246 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 RTN2O75298 545 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CLSTN1O94985 981 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 FMO1Q01740 532 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 PDCLQ13371 301 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 MESDQ14696 234 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SHC3Q92529 594 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 PICK1Q9NRD5 415 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 USP20Q9Y2K6 914 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 TULP2O00295 520 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 BAG6P46379 1132 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.28■■□□□ 1.32
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms