RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.99■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.98■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 EPHB6O15197 1021 aa21.98■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 CASP14P31944 242 aa21.98■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 ABCD1P33897 745 aa21.98■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 KCNMA1Q12791 1236 aa21.98■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.98■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.98■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 SCLT1Q96NL6 688 aa21.98■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 FGFR4P22455 802 aa21.97■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ODC1-202ENST00000405333 ACOT2P49753 483 aa21.97■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.97■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.96■■□□□ 1.11
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ODC1-202ENST00000405333 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.95■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.95■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 OSMRQ99650 979 aa21.95■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.95■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.95■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.95■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.95■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 VAMP7P51809 220 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 ACLYP53396 1101 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 CCZ1BP86790 482 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PPP3CAQ08209 521 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 MTFR1Q15390 333 aa21.94■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 CPB2Q96IY4 423 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TCHPQ9BT92 498 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.17e-8■■□□□ 13.3
ODC1-202ENST00000405333 CLDN3O15551 220 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 FAM189A1O60320 539 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 MFAP3LO75121 409 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TOM1L1O75674 476 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 KRT13P13646 458 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TNFSF9P41273 254 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.94■■□□□ 1.1
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