RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 MLH1P40692 756 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 NPTX2P47972 431 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 MAPK7Q13164 816 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CNNM3Q8NE01 707 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CALML4Q96GE6 196 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ZFP42Q96MM3 310 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 USP28Q96RU2 1077 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 GAD1Q99259 594 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 LINC01565O15544 149 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 BMP1P13497 986 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PLCG1P19174 1290 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 NRIP1P48552 1158 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC12A3P55017 1021 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PLCB3Q01970 1234 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 KRT17Q04695 432 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 UBE3AQ05086 875 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM187BQ17R55 369 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 USP49Q70CQ1 688 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 EPSTI1Q96J88 318 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 DRC1Q96MC2 740 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CLIC6Q96NY7 704 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 TCF25Q9BQ70 676 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 KLK14Q9P0G3 267 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ARL5CA6NH57 179 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ACKR2O00590 384 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PER2O15055 1255 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 DDHD2O94830 711 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC11A1P49279 550 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 EFNA5P52803 228 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PARP2Q9UGN5 583 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 K7ERI5 159 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC16A4O15374 487 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 GALTP07902 379 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 GUCY2CP25092 1073 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 SCNN1GP51170 649 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 MCM6Q14566 821 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 CLUL1Q15846 466 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 HACE1Q8IYU2 909 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 MIOSQ9NXC5 875 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 LZTS1Q9Y250 596 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRN2-204ENST00000404321 HIDE1A8MVS5 230 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 FSCN2O14926 492 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 N4BP3O15049 544 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 CA8P35219 290 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 ARSHQ5FYA8 562 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 TMC7Q7Z402 723 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 GPBP1Q86WP2 473 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM169Q96HH4 297 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 TLE6Q9H808 572 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 TTC28Q96AY4 2481 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 LTBRP36941 435 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 PKP1Q13835 747 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 COL19A1Q14993 1142 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 LEXMQ3ZCV2 418 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 ATF7IP2Q5U623 682 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 RAD54LQ92698 747 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 IGSF21Q96ID5 467 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 TIPINQ9BVW5 301 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 SNTG2Q9NY99 539 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 GIT1Q9Y2X7 761 aa20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTPRN2-204ENST00000404321 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms