RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 SLC35C1Q96A29 364 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.178e-7■■□□□ 13.8
ATG4B-204ENST00000402096 FZD8Q9H461 694 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ADRB2P07550 413 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CDC42EP1Q00587 391 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MAPK13O15264 365 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CLDN3O15551 220 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 B4GALT5O43286 388 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM49P0CI25 452 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM49CP0CI26 452 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 KLK7P49862 253 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ACLYP53396 1101 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 RBL2Q08999 1139 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 LHX8Q68G74 356 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB33Q86T24 672 aa22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 EXTL3O43909 919 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TOM1L1O75674 476 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CABYRO75952 493 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 HOXC8P31273 242 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 VAMP7P51809 220 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM14Q14142 442 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ERLIN2O94905 339 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 IQCF3P0C7M6 154 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CASP14P31944 242 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 LRMPQ12912 555 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 A0A0B4J269 797 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF233A6NK53 670 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GPR32O75388 356 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GYPCP04921 128 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ACOT2P49753 483 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 FAM187BQ17R55 369 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 FBXL18Q96ME1 805 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 OSMRQ99650 979 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 NUP58Q9BVL2 599 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 DLG4P78352 724 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 NME8Q8N427 588 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 FGFR4P22455 802 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 FMO5P49326 533 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CYP24A1Q07973 514 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 ITGA7Q13683 1181 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 USP37Q86T82 979 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 NEK11Q8NG66 645 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CPB2Q96IY4 423 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-204ENST00000402096 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.3■■□□□ 1.16
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