RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 ECT2Q9H8V3 914 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MCF2P10911 925 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 VEPH1Q14D04 833 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 VPS11Q9H270 941 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ASB14A6NK59 587 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT14P02533 472 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 PFASO15067 1338 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 CREB3O43889 395 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 BRAFP15056 766 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 M0QYV0 167 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 GPS1Q13098 491 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 KCNB1Q14721 858 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 EPC1Q9H2F5 836 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM247A6NEH6 219 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT7P08729 469 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 SMARCA1P28370 1054 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 RASSF3Q86WH2 238 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 CHRNA5P30532 468 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 RFFLQ8WZ73 363 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 STOML1Q9UBI4 398 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 DYRK4Q9NR20 520 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 SNX2O60749 519 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ROR1Q01973 937 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MED14O60244 1454 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 CEP19Q96LK0 163 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 NCLNQ969V3 563 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ORC4O43929 436 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 SDC4P31431 198 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 PPM1NQ8N819 430 aa22.72■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ARFIP2P53365 341 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 TDP2O95551 362 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ADORA2BP29275 332 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 LXNQ9BS40 222 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGDIAP52565 204 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ABCC3O15438 1527 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 SNAP23O00161 211 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 SP8Q8IXZ3 490 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ASIC4Q96FT7 647 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 ACAP3Q96P50 834 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 POLD4Q9HCU8 107 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 MICALL2Q8IY33 904 aa22.7■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 COG1Q8WTW3 980 aa22.7■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 SP110Q9HB58 689 aa22.7■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 DCTN4Q9UJW0 460 aa22.7■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.7■■□□□ 1.23
ANKRD28-201ENST00000399451 A0A0G2JLW4 131 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms