RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 YY1P25490 414 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 NOS3P29474 1203 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 RARRES1P49788 294 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 DNM2P50570 870 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 CASP5P51878 434 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PSMC5P62195 406 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 SNAPC2Q13487 334 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC41Q15345 812 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 STXBP2Q15833 593 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 GNPTABQ3T906 1256 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 FIGNQ5HY92 759 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 SFR1Q86XK3 245 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 DAW1Q8N136 415 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 RETREG2Q8NC44 543 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 IQCDQ96DY2 449 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 FGD4Q96M96 766 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TSG101Q99816 390 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.64□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PQJ5 194 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP6O43182 974 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TGFB1I1O43294 461 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.351e-323■□□□□ 11.3
C6orf48-208ENST00000395788 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TGFB3P10600 412 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ERCC3P19447 782 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TERF1P54274 439 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 CNTN2Q02246 1040 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 RBL2Q08999 1139 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MYBPC2Q14324 1141 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PLS1Q14651 629 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MAN2A1Q16706 1144 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 UGCGQ16739 394 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN21Q16825 1174 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 VWA3BQ502W6 1294 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 CEP135Q66GS9 1140 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 BANK1Q8NDB2 785 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJC7Q99615 494 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 NUP58Q9BVL2 599 aa6.63□□□□□ -1.35
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C6orf48-208ENST00000395788 VPS16Q9H269 839 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MROH8Q9H579 483 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.63□□□□□ -1.35
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C6orf48-208ENST00000395788 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.63□□□□□ -1.35
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C6orf48-208ENST00000395788 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.63□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 B4DLN1 442 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 TRAF5O00463 557 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 NRDCO43847 1150 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF862O60290 1169 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PEX10O60683 326 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 HIP1RO75146 1068 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 FAM13AO94988 1023 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 INHAP05111 366 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 PSAPP07602 524 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 MYBP10242 640 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 CETPP11597 493 aa6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
C6orf48-208ENST00000395788 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
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