RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.44■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.44■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 GNA14O95837 355 aa25.43■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.43■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.42■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 A0A0B4J269 797 aa25.42■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 B4GALT4O60513 344 aa25.42■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 SNX17Q15036 470 aa25.42■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.42■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 EEF1DP3Q658K8 133 aa25.42■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.42■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.42■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 SPC24Q8NBT2 197 aa25.42■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 PTPRHQ9HD43 1115 aa25.42■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 ATF7IP2Q5U623 682 aa25.41■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.41■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 CBFA2T2O43439 604 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 TSPAN1O60635 241 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 TOM1L1O75674 476 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 CHRNA1P02708 482 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 PROZP22891 400 aa25.4■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 SEZ6Q53EL9 994 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.4■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 LGALS16A8MUM7 142 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 CLDN3O15551 220 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 CDK7P50613 346 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 FBXL18Q96ME1 805 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 TCHPQ9BT92 498 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 NDST4Q9H3R1 872 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 NOD1Q9Y239 953 aa25.4■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 THPOP40225 353 aa25.39■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.39■■□□□ 1.66
CNN3-202ENST00000394202 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.39■■□□□ 1.66
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CNN3-202ENST00000394202 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CNN3-202ENST00000394202 SLC35C1Q96A29 364 aa25.38■■□□□ 1.65
CNN3-202ENST00000394202 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.38■■□□□ 1.65
CNN3-202ENST00000394202 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.38■■□□□ 1.65
CNN3-202ENST00000394202 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
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CNN3-202ENST00000394202 PBX1P40424 430 aa25.38■■□□□ 1.65
CNN3-202ENST00000394202 DLG4P78352 724 aa25.38■■□□□ 1.65
CNN3-202ENST00000394202 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.38■■□□□ 1.65
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