RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CREB3O43889 395 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 S100BP04271 92 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT7P08729 469 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT3P12035 628 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SATB1Q01826 763 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 Q9H521 79 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM187AA6NFU0 413 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 DGAT1O75907 488 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT14P02533 472 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PMLP29590 882 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP2R2AP63151 447 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC14Q15048 493 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TFR2Q9UP52 801 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PI4K2BG5E9Z4 385 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MYO1CO00159 1063 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CAV1Q03135 178 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 XKR3Q5GH77 459 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT38O76015 456 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GGPS1O95749 300 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ATG16L1Q676U5 607 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 A8MXQ7 604 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM72Q6ZMU5 477 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 LPAR1Q92633 364 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K14Q99558 947 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GMNCA6NCL1 334 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ADORA2BP29275 332 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM151AQ8WW52 585 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 RTN2O75298 545 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GNAT1P11488 350 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 RPA1P27694 616 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PEX19P40855 299 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP4CP60510 307 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF12Q96FN5 646 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM55Q9BYV6 548 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TMCO4Q5TGY1 634 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 EXT2Q93063 718 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS39Q96JC1 886 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC4O95801 387 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGEF6Q15052 776 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CDH6P55285 790 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 E2F4Q16254 413 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MORC4Q8TE76 937 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS11Q9H270 941 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 DIP2AQ14689 1571 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 EFNA5P52803 228 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 CPA5Q8WXQ8 436 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 AGBL1Q96MI9 1066 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8OA6NCC3 632 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8NF8WBI6 632 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TTI1O43156 1089 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PRKCBP05771 671 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 NPEPPSP55786 919 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TMTC4Q5T4D3 741 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SPDL1Q96EA4 605 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 PARVAQ9NVD7 372 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 MYBL1P10243 752 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 NCAPHQ15003 741 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 HIPK4Q8NE63 616 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ELP3Q9H9T3 547 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 DCTN4Q9UJW0 460 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 REREQ9P2R6 1566 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC37A4O43826 429 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 ELF1P32519 619 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-202ENST00000392011 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms