RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SYDE2Q5VT97 1194 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 DENND2CQ68D51 928 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 TMEM109Q9BVC6 243 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 PICK1Q9NRD5 415 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 EZRP15311 586 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 PTPRAP18433 802 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 JAMLQ86YT9 394 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa28.47■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.156e-7■■□□□ 13.5
PXDC1-202ENST00000380283 AP3B2Q13367 1082 aa28.46■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 CEP57Q86XR8 500 aa28.46■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.46■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 OLFML3Q9NRN5 406 aa28.46■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 SCN4AP35499 1836 aa28.46■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 AGTP01019 485 aa28.45■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 GBP1P32455 592 aa28.45■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.154e-8■■□□□ 11.9
PXDC1-202ENST00000380283 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.45■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 PRR12Q9ULL5 1215 aa28.45■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.45■■■□□ 2.15
PXDC1-202ENST00000380283 TGFB1I1O43294 461 aa28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 VCAM1P19320 739 aa28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 HADHBP55084 474 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 SPP2Q13103 211 aa28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 Q4G0T1 1027 aa28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 C6orf118Q5T5N4 469 aa28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 GLG1Q92896 1179 aa28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 SCLT1Q96NL6 688 aa28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa28.45■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 MEIS1O00470 390 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 OPLAHO14841 1288 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 HSPA6P17066 643 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 SNAP25P60880 206 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 FBXO25Q8TCJ0 367 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 MKNK1Q9BUB5 465 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 WDR18Q9BV38 432 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 GPR88Q9GZN0 384 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 GRHL1Q9NZI5 618 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 DOCK1Q14185 1865 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 RPTORQ8N122 1335 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 CLIC2O15247 247 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ATP2C2O75185 946 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 GCNT3O95395 438 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 RSPH10BP0C881 870 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PTGIRP43119 386 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PLTPP55058 493 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ADCY2Q08462 1091 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 TRPC6Q9Y210 931 aa28.44■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ATP6V1G2O95670 118 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGAP4P98171 946 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 CHURC1Q8WUH1 139 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 LPAR1Q92633 364 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGEF26Q96DR7 871 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ANKRD62A6NC57 917 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PHF2O75151 1096 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 RIPK1Q13546 671 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 MTMR2Q13614 643 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 FAM186BQ8IYM0 893 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ALG3Q92685 438 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 LENG9Q96B70 501 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 SELENOSQ9BQE4 189 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PCYOX1Q9UHG3 505 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 SNX24Q9Y343 169 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa28.43■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 MEIS2O14770 477 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 GAP43P17677 238 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 CHRNA3P32297 505 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 FMO5P49326 533 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 KCNA1Q09470 495 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 DGKZQ13574 1117 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 SLC29A2Q14542 456 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 TLDC1Q6P9B6 456 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 LRRC34Q8IZ02 419 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF280CQ8ND82 737 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 CEP83Q9Y592 693 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa28.42■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 PLA2G6O60733 806 aa28.41■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 ABCB4P21439 1286 aa28.41■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 COPB2P35606 906 aa28.41■■■□□ 2.14
PXDC1-202ENST00000380283 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100 ms