RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371935.6

REXO4-201, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene REXO4, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-201ENST00000371935 KATNBL1Q9H079 304 aa27.35■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 GAS2O43903 313 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 LRRN2O75325 713 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 GRB14Q14449 540 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 IER5Q5VY09 327 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 ARHGEF19Q8IW93 802 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 FAM213AQ9BRX8 229 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 ZNF236Q9UL36 1845 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 EXTL3O43909 919 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 ADCY3O60266 1144 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 C10orf76Q5T2E6 689 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 KRT39Q6A163 491 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 FMNL3Q8IVF7 1028 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 TCP11Q8WWU5 503 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 UBXN4Q92575 508 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 TMEM8AQ9HCN3 771 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.34■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 EDN1P05305 212 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 GTF2H1P32780 548 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 LAMC2Q13753 1193 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 USP37Q86T82 979 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 CEP112Q8N8E3 955 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 OLIG1Q8TAK6 271 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 KIAA1586Q9HCI6 787 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 NAGPAQ9UK23 515 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 COQ4Q9Y3A0 265 aa27.33■■□□□ 1.97
REXO4-201ENST00000371935 NAB2Q15742 525 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ARHGAP44Q17R89 818 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 VTI1AQ96AJ9 217 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 PACSIN1Q9BY11 444 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 HAPLN2Q9GZV7 340 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ATP8B3O60423 1300 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 MYH10P35580 1976 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ZNF233A6NK53 670 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 GH1P01241 217 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 TFRCP02786 760 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 VPS36Q86VN1 386 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 SEMA4DQ92854 862 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ALS2CR12Q96Q35 445 aa27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 HUNKP57058 714 aa27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 SLFN12LQ6IEE8 588 aa27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 PLEKHH3Q7Z736 793 aa27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 SYT11Q9BT88 431 aa27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 SUGCTQ9HAC7 445 aa27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 TRPC6Q9Y210 931 aa27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 JRKLQ9Y4A0 524 aa27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 SAR1BQ9Y6B6 198 aa27.31■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.963e-17■■■■□ 22.6
REXO4-201ENST00000371935 HBP1O60381 514 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 KIF22Q14807 665 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 DPP9Q86TI2 863 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 LRRC71Q8N4P6 559 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 NOX5Q96PH1 765 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 CCDC172P0C7W6 258 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 KLRC1P26715 233 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 MAPK4P31152 587 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 CHMP4BP1P59074 171 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 GOLGA1Q92805 767 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 MAML3Q96JK9 1138 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 CCDC113Q9H0I3 377 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ERAP1Q9NZ08 941 aa27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 BTNL10A8MVZ5 291 aa27.29■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 ADCYAP1R1P41586 468 aa27.29■■□□□ 1.96
REXO4-201ENST00000371935 GPC3P51654 580 aa27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms