RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TEX101Q9BY14 249 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RSAD1Q9HA92 442 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPON1Q9HCB6 807 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1272P-201ENST00000362776 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1272P-201ENST00000362776 INSL6Q9Y581 213 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COX11Q9Y6N1 276 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COL4A3Q01955 1670 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MYPNQ86TC9 1320 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HKR1P10072 659 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDK4P11802 303 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CXCR5P32302 372 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FLT3P36888 993 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLA2G5P39877 138 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PTH2RP49190 550 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SEC24CP53992 1094 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRTAP10-11P60412 298 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GUCY1B3Q02153 619 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MGAT5Q09328 741 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FOXI1Q12951 378 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRR16Q569H4 304 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SYT12Q8IV01 421 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZZZ3Q8IYH5 903 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LILRB2Q8N423 598 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNF169Q8NCN4 708 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LINC00476Q8WZB0 136 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ARMC5Q96C12 935 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 USP18Q9UMW8 372 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MARCH11A6NNE9 402 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF185O15231 689 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NRP2O60462 931 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRAMEF4O60810 478 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PFKMP08237 780 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SDSP20132 328 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CD40P25942 277 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BMPR1AP36894 532 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPARAQ07869 468 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TP53BP2Q13625 1128 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CFAP100Q494V2 611 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LMBR1LQ6UX01 489 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BTNL9Q6UXG8 535 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC44A3Q8N4M1 653 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EFHBQ8N7U6 833 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GAB3Q8WWW8 586 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ASB10Q8WXI3 467 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COQ10AQ96MF6 247 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADAM2Q99965 735 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MSRAQ9UJ68 235 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CLCA2Q9UQC9 943 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 A0A1W2PR48 441 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 B5MCH6 92 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DIRC3C9JPN6 131 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KPNA6O60684 536 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GAS7O60861 476 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPDEFO95238 335 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 C1RP00736 705 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ERBB2P04626 1255 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HLA-DOAP06340 250 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPATA31D3P0C874 917 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 XPAP23025 273 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NRG3P56975 720 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BLOC1S1P78537 153 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RBL2Q08999 1139 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LRRC32Q14392 662 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ANKS6Q68DC2 871 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TAS1R1Q7RTX1 841 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GLB1L2Q8IW92 636 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SIMC1Q8NDZ2 872 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TFAP2CQ92754 450 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NELL1Q92832 810 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MKL1Q969V6 931 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LRFN3Q9BTN0 628 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 POGKQ9P215 609 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DKK2Q9UBU2 259 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms