RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 DDIT3P35638 169 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 TXLNAP40222 546 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 GIT2Q14161 759 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM132AQ24JP5 1023 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 RRAGBQ5VZM2 374 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 SHC4Q6S5L8 630 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 KCNT2Q6UVM3 1135 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
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TPGS1-201ENST00000359315 STK17AQ9UEE5 414 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa29.73■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 K7ERI5 159 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 FGF18O76093 207 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 AKAP5P24588 427 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 IRS1P35568 1242 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 MLH1P40692 756 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PTPROQ16827 1216 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF280BQ86YH2 543 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 THNSL1Q8IYQ7 743 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PDILTQ8N807 584 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 CNNM3Q8NE01 707 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 POF1BQ8WVV4 589 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 SPIRE2Q8WWL2 714 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZFP42Q96MM3 310 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 GAD1Q99259 594 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 AAASQ9NRG9 546 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa29.72■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 N4BP3O15049 544 aa29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 POMCP01189 267 aa29.71■■■□□ 2.35
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TPGS1-201ENST00000359315 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF558Q96NG5 402 aa29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM134Q9H6X4 195 aa29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJB4Q9UDY4 337 aa29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ODF2LQ9ULJ1 636 aa29.71■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 CUTAO60888 179 aa29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 DDHD2O94830 711 aa29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 TCEAL5Q5H9L2 206 aa29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ATF7IP2Q5U623 682 aa29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 GBP3Q9H0R5 595 aa29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 MIOSQ9NXC5 875 aa29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHA7Q9UN72 937 aa29.7■■■□□ 2.35
TPGS1-201ENST00000359315 ARL5CA6NH57 179 aa29.69■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 KRT18P05783 430 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF131P52739 623 aa29.69■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 BCAR1P56945 870 aa29.69■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 SLC39A11Q8N1S5 342 aa29.69■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 SLC17A8Q8NDX2 589 aa29.69■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 KCNG4Q8TDN1 519 aa29.69■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
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TPGS1-201ENST00000359315 KLK14Q9P0G3 267 aa29.69■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 TRANK1O15050 2925 aa29.69■■■□□ 2.34
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TPGS1-201ENST00000359315 FAM13AO94988 1023 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 MAPTP10636 758 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
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TPGS1-201ENST00000359315 SCNN1GP51170 649 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 NCKAP1LP55160 1127 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 TIGD5Q53EQ6 642 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 ATL3Q6DD88 541 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 DYMQ7RTS9 669 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 GSTCDQ8NEC7 633 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 URGCPQ8TCY9 931 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 FIZ1Q96SL8 496 aa29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
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TPGS1-201ENST00000359315 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 INPPL1O15357 1258 aa29.67■■■□□ 2.34
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TPGS1-201ENST00000359315 SLC11A1P49279 550 aa29.67■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 E2F4Q16254 413 aa29.67■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa29.67■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 MYCT1Q8N699 235 aa29.67■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 SNTG2Q9NY99 539 aa29.67■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
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TPGS1-201ENST00000359315 RCOR1Q9UKL0 485 aa29.67■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP45Q9UL16 551 aa29.67■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 TNFSF13BQ9Y275 285 aa29.67■■■□□ 2.34
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TPGS1-201ENST00000359315 ABLIM1O14639 778 aa29.66■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 CEP120Q8N960 986 aa29.66■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 DDX12PQ92771 950 aa29.66■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 CDT1Q9H211 546 aa29.66■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
TPGS1-201ENST00000359315 PARVGQ9HBI0 331 aa29.66■■■□□ 2.34
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