RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 MCUQ8NE86 351 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 MMP1P03956 469 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 SAMD9Q5K651 1589 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT1P04264 644 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL23Q8NBE8 558 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 FANCBQ8NB91 859 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 NDST4Q9H3R1 872 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 TOM1O60784 492 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP6V1G2O95670 118 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 PDHBP11177 359 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXC8P31273 242 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ANGPT2O15123 496 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KITP10721 976 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 NQO1P15559 274 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 USP44Q9H0E7 712 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 SORBS3O60504 671 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 AP1G2O75843 785 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE9AO76083 593 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 AP3M2P53677 418 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 HPS3Q969F9 1004 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE8AO60658 829 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ERICH1Q86X53 443 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 C8orf4Q9NR00 106 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 P3H1Q32P28 736 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX2O60749 519 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRN2O75325 713 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 SNAPC5O75971 98 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 PPARAQ07869 468 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 TMC4Q7Z404 712 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNQ4P56696 695 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 UBE3CQ15386 1083 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC14Q15048 493 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 MMS19Q96T76 1030 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 GINS2Q9Y248 185 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP7AQ04656 1500 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNE1P24864 410 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ICA1Q05084 483 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT72Q14CN4 511 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRNA2Q15822 529 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 A8MXQ7 604 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 IL13P35225 146 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 DISC1Q9NRI5 854 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 CEP44Q9C0F1 390 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 GGT7Q9UJ14 662 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 NCAPD2Q15021 1401 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 FGAP02671 866 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT20P35900 424 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 PIGUQ9H490 435 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 BEST2Q8NFU1 509 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 EME1Q96AY2 570 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 NGLY1Q96IV0 654 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-201ENST00000356331 ANO3Q9BYT9 981 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms