RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.16■□□□□ 0.82
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SPNS1-204ENST00000352260 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 P3H4Q92791 437 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ARL8AQ96BM9 186 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 CEP170P1Q96L14 293 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC42Q96M95 316 aa20.16■□□□□ 0.82
SPNS1-204ENST00000352260 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.16■□□□□ 0.82
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SPNS1-204ENST00000352260 ZNF185O15231 689 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPNS1-204ENST00000352260 SLC9A1P19634 815 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPNS1-204ENST00000352260 MYBPC2Q14324 1141 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPNS1-204ENST00000352260 CFAP58Q5T655 872 aa20.15■□□□□ 0.82
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SPNS1-204ENST00000352260 ZNF263O14978 683 aa20.14■□□□□ 0.81
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SPNS1-204ENST00000352260 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.14■□□□□ 0.81
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SPNS1-204ENST00000352260 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
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SPNS1-204ENST00000352260 NLRP14Q86W24 1093 aa20.13■□□□□ 0.81
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SPNS1-204ENST00000352260 SIX2Q9NPC8 291 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-204ENST00000352260 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-204ENST00000352260 DGAT1O75907 488 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-204ENST00000352260 SERPING1P05155 500 aa20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-204ENST00000352260 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-204ENST00000352260 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPNS1-204ENST00000352260 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.12■□□□□ 0.81
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