RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 FSD2A1L4K1 749 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FRMD3A2A2Y4 597 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC169A6NNP5 214 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM13AO94988 1023 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PIGRP01833 764 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 KRT18P05783 430 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FOSL2P15408 326 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 STRN3Q13033 797 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 SHC4Q6S5L8 630 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 URGCPQ8TCY9 931 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 LRRC15Q8TF66 581 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 RSAD1Q9HA92 442 aa13.43□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 NCK2O43639 380 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TRAK2O60296 914 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 LPXNO60711 386 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 OFD1O75665 1012 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TOM1L1O75674 476 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ITGA4P13612 1032 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PROZP22891 400 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 GTF2BQ00403 316 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PLCB3Q01970 1234 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 NOMO2Q5JPE7 1267 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CLLU1OSQ5K130 101 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 SPECC1Q5M775 1068 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ATF7IP2Q5U623 682 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM178BQ8IXR5 827 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 DDX12PQ92771 950 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAJC19Q96DA6 116 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PLIN2Q99541 437 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PRDM12Q9H4Q4 367 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 KCNH3Q9ULD8 1083 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 IPPQ9Y573 584 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.42□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TCHHQ07283 1943 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ARHGEF15O94989 841 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 SLFN14P0C7P3 912 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MCF2P10911 925 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FGFR1P11362 822 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CTNNB1P35222 781 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TIGD5Q53EQ6 642 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 AGMOQ6ZNB7 445 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 HAUS6Q7Z4H7 955 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MYCT1Q8N699 235 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FAM161BQ96MY7 647 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CWH43Q9H720 699 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 HPSEQ9Y251 543 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MTCH2Q9Y6C9 303 aa13.41□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 REV3LO60673 3130 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A087X0B3 334 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MYMKA6NI61 221 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC16A4O15374 487 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 B4GALT5O43286 388 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 KRT17Q04695 432 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 GPM6BQ13491 265 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MPZL3Q6UWV2 235 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF720Q7Z2F6 126 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MAP4K3Q8IVH8 894 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 GPR65Q8IYL9 337 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 HELQQ8TDG4 1101 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 MYLIPQ8WY64 445 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP2R3CQ969Q6 453 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 CPB2Q96IY4 423 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF558Q96NG5 402 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 FIZ1Q96SL8 496 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 STRA6Q9BX79 667 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM9Q9C026 710 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 TBX20Q9UMR3 447 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PLAGL2Q9UPG8 496 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.4□□□□□ -0.26
KCNQ1-203ENST00000345015 ARL5CA6NH57 179 aa13.39□□□□□ -0.27
KCNQ1-203ENST00000345015 SFI1A8K8P3 1242 aa13.39□□□□□ -0.27
KCNQ1-203ENST00000345015 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
KCNQ1-203ENST00000345015 NR1I2O75469 434 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms