RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEB5Q9BZ81 275 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF521Q96K83 1311 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 EMBQ6PCB8 327 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DCTN3O75935 186 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PFDN1O60925 122 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC6O75061 913 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP69BQ9UJL9 534 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 GYG2O15488 501 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEP78395 509 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 AGR3Q8TD06 166 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 H0Y3Z8 333 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DIAPH2O60879 1101 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SPAG7O75391 227 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 RMDN1Q96DB5 314 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 COG4Q9H9E3 785 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 RGL1Q9NZL6 768 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 GUCY1A2P33402 732 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 FOXO4P98177 505 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 NFIXQ14938 502 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TEX33O43247 280 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 BCAR1P56945 870 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 RAET1EQ8TD07 263 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 GGCXP38435 758 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0G2JLW4 131 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.391e-6■■■□□ 16.9
PTPRM-201ENST00000332175 ATP9BO43861 1147 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 FSCBQ5H9T9 825 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 HPS3Q969F9 1004 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 MBD5Q9P267 1494 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 CTSHP09668 335 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SCARF1Q14162 830 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 COPB2P35606 906 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SULT1E1P49888 294 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SP8Q8IXZ3 490 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 CASS4Q9NQ75 786 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 CDH6P55285 790 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 RGS9BPQ6ZS82 235 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 POLE2P56282 527 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PTK2BQ14289 1009 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 MICALL2Q8IY33 904 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 LZICQ8WZA0 190 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 CYP26A1O43174 497 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PRKCBP05771 671 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 IFNA8P32881 189 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 KRT7P08729 469 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 NT5C2P49902 561 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TRIML2Q8N7C3 387 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TMCC1O94876 653 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SETSIPP0DME0 302 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM143Q96AN5 459 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 RALAP11233 206 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SKIP12755 728 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ADRA2BP18089 450 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DDIASQ8IXT1 998 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R36Q96LQ0 422 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ASB14A6NK59 587 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 MYBL1P10243 752 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF235Q14590 738 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC14Q15048 493 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-201ENST00000332175 DUOXA2Q1HG44 320 aa23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms