RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 PSMD10O75832 226 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 COMTP21964 271 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 CUL1Q13616 776 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC14Q15048 493 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 PASD1Q8IV76 773 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 RAPGEF5Q92565 580 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 HVCN1Q96D96 273 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 GMCL1Q96IK5 515 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ASIC3Q9UHC3 531 aa21.38■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ITGB5P18084 799 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SCFD2Q8WU76 684 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 FOXO6A8MYZ6 492 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 CAND2O75155 1236 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SMTNP53814 917 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 DENND2CQ68D51 928 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.37■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 TBK1Q9UHD2 729 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 MMEP08473 750 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 IDI2Q9BXS1 227 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SCTRP47872 440 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 BIRC3Q13489 604 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 AZI2Q9H6S1 392 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 MTMR1Q13613 665 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 RAB17Q9H0T7 212 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 YDJCA8MPS7 323 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC188H7C350 402 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SLC29A2Q14542 456 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 NUP85Q9BW27 656 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 CYP3A4P08684 503 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 JAMLQ86YT9 394 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 COL20A1Q9P218 1284 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 CLDN3O15551 220 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 MIEF2Q96C03 454 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 PRKCIP41743 596 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 JAM2P57087 298 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 TMC3Q7Z5M5 1100 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 FAM228AQ86W67 206 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ENO4A6NNW6 628 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 PPP2R2AP63151 447 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 MTM1Q13496 603 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 MYH4Q9Y623 1939 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD62A6NC57 917 aa21.33■■□□□ 1
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM253P0C7T8 217 aa21.33■■□□□ 1
SPNS2-201ENST00000329078 CIITAP33076 1130 aa21.33■■□□□ 1
SPNS2-201ENST00000329078 DAW1Q8N136 415 aa21.33■■□□□ 1
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
SPNS2-201ENST00000329078 ACCSQ96QU6 501 aa21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms