RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSPBP1Q9NZL4 362 aa29.99■■■□□ 2.39
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CTDNEP1-201ENST00000318988 USP20Q9Y2K6 914 aa29.99■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOM1L1O75674 476 aa29.98■■■□□ 2.39
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A4Q6P5W5 647 aa29.98■■■□□ 2.39
CTDNEP1-201ENST00000318988 XXYLT1Q8NBI6 393 aa29.98■■■□□ 2.39
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.95■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB33Q86T24 672 aa29.94■■■□□ 2.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA8JA6NMD2 632 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PES1O00541 588 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXTL3O43909 919 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT13P13646 458 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARSP56192 900 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCL1Q07820 350 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOTUMQ6P988 496 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOX2Q96NM4 488 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM213AQ9BRX8 229 aa29.91■■■□□ 2.38
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