RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 PEX19P40855 299 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SATB1Q01826 763 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CGB2Q6NT52 195 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 CROCCP2Q86T23 111 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 RHOT2Q8IXI1 618 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 BATF3Q9NR55 127 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 UFL1O94874 794 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM167BQ9BTA0 163 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACP6Q9NPH0 428 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1A-201ENST00000317991 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 UPP2O95045 317 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRAPQ13588 217 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASRGL1Q7L266 308 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 PWWP2AQ96N64 755 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBK1Q9UHD2 729 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM13AO94988 1023 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GJB6O95452 261 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP4X1Q8N118 509 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1orf54Q8WWF1 131 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRYGNQ8WXF5 182 aa23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSH4O15457 936 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYL7Q01449 175 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SNX1Q13596 522 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF22Q14807 665 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF568Q3ZCX4 644 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 EP400Q96L91 3159 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSPA6P17066 643 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 KYNUQ16719 465 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAJC18Q9H819 358 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 PASKQ96RG2 1323 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GBP1P32455 592 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHMT1P34896 483 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GPC5P78333 572 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 DLG4P78352 724 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALCOCO2Q13137 446 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLUL1Q15846 466 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 USH1GQ495M9 461 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.422e-7■■■□□ 16.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 BRAFP15056 766 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRIK3Q13003 919 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 VAV3Q9UKW4 847 aa23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GAKO14976 1311 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC26A4O43511 780 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 EYA4O95677 639 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 TPH2Q8IWU9 490 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 LMO3Q8TAP4 145 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 KAT5Q92993 513 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CETPP11597 493 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABL2P42684 1182 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFT74Q96LB3 600 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNPATO15228 680 aa23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLDN3O15551 220 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms