RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317568.9

FRMD8-201, Transcript of FERM domain containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FRMD8, Length 3,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD8-201ENST00000317568 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 E9PMD0 336 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PDE5AO76074 875 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 LMNB1P20700 586 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 GALK1P51570 392 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 TRIP10Q15642 601 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 IL17AQ16552 155 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 TPBGLP0DKB5 382 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 CHRNA3P32297 505 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 MMP13P45452 471 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PKN1Q16512 942 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 FIGNQ5HY92 759 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ERLEC1Q96DZ1 483 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PWWP2AQ96N64 755 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 MX2P20592 715 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 KCNQ4P56696 695 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ACAP1Q15027 740 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 IYDQ6PHW0 289 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ECHDC2Q86YB7 292 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PGM2Q96G03 612 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 TMEM260Q9NX78 707 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ABCA3Q99758 1704 aa14.66□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 CLDN3O15551 220 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PALM2Q8IXS6 379 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 MYCT1Q8N699 235 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 TEKT1Q969V4 418 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 COA7Q96BR5 231 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 BTG4Q9NY30 223 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ARMCX1Q9P291 453 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 USP17L3A6NCW0 530 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 USP17L4A6NCW7 530 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 RIPK2O43353 540 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PIAS1O75925 651 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 NPTXRO95502 500 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 SLC34A1Q06495 639 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 COASYQ13057 564 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PICALMQ13492 652 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 CENPTQ96BT3 561 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ZNF653Q96CK0 615 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 O00370 1275 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PJA2O43164 708 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 MTBPQ96DY7 904 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 DCAF5Q96JK2 942 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 ALG6Q9Y672 507 aa14.65□□□□□ -0.06
FRMD8-201ENST00000317568 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 ASPHQ12797 758 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 AK8Q96MA6 479 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 CACNA1FO60840 1977 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 CDH16O75309 829 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 DDAH1O94760 285 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 ZWINTO95229 277 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 CLUL1Q15846 466 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 PHF12Q96QT6 1004 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.64□□□□□ -0.07
FRMD8-201ENST00000317568 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms