RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 KCNN1Q92952 543 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD4-201ENST00000306324 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R37O75864 691 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 NPTXRO95502 500 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 STAG3L1P0CL83 205 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 RAB27AP51159 221 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 FAM189BP81408 668 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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HOXD4-201ENST00000306324 SKIP12755 728 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 LIG4P49917 911 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 RABGGTBP53611 331 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ALCAMQ13740 583 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 HVCN1Q96D96 273 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 TCHPQ9BT92 498 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 STRA6Q9BX79 667 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 TRIP11Q15643 1979 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 KCNA1Q09470 495 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ZPBP2Q6X784 338 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ACCSQ96QU6 501 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 CITO14578 2027 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 TLL1O43897 1013 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 SMC2O95347 1197 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 MCM4P33991 863 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PSMD2Q13200 908 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 CAMK4Q16566 473 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB33Q86T24 672 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 LPPQ93052 612 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 SMARCE1Q969G3 411 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 IPPQ9Y573 584 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF623O75123 536 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 RHOBTB3O94955 611 aa24.48■■□□□ 1.51
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HOXD4-201ENST00000306324 STK4Q13043 487 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 GPT2Q8TD30 523 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 YME1L1Q96TA2 773 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 APOL6Q9BWW8 343 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 HES2Q9Y543 173 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 TOM1L1O75674 476 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 FGFR1P11362 822 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 KCNB1Q14721 858 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.47■■□□□ 1.51
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HOXD4-201ENST00000306324 PGBD4Q96DM1 585 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 GSDMAQ96QA5 445 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 RMND1Q9NWS8 449 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN3O15551 220 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PIGRP01833 764 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PROZP22891 400 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 PBX2P40425 430 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 RAD9AQ99638 391 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 CDT1Q9H211 546 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM206Q9H813 350 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 INSL6Q9Y581 213 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.45■■□□□ 1.51
HOXD4-201ENST00000306324 DGKIO75912 1065 aa24.45■■□□□ 1.51
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