RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303927.3

CAVIN3-201, Transcript of caveolae associated protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAVIN3, Length 1,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3-201ENST00000303927 BSNDQ8WZ55 320 aa22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC51Q96ER9 411 aa22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 CLIC6Q96NY7 704 aa22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 CLEC1BQ9P126 229 aa22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 CFAP45Q9UL16 551 aa22.12■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 TSPAN1O60635 241 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 HIP1RO75146 1068 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 BRD1O95696 1058 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 UBE3AQ05086 875 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 SPECC1Q5M775 1068 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 NOTUMQ6P988 496 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 EPSTI1Q96J88 318 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.11■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF623O75123 536 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 FGF18O76093 207 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 GLP2RO95838 553 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 AMHR2Q16671 573 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM187BQ17R55 369 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 ABI1Q8IZP0 508 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 TLR9Q9NR96 1032 aa22.1■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 EFNA5P52803 228 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 COASYQ13057 564 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 MAPK6Q16659 721 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 USP49Q70CQ1 688 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 DAW1Q8N136 415 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 RNF169Q8NCN4 708 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 CNNM3Q8NE01 707 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 RAD54LQ92698 747 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 PGBD4Q96DM1 585 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 FZD8Q9H461 694 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 CWH43Q9H720 699 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 TLE6Q9H808 572 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 STK17AQ9UEE5 414 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.09■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 LAG3P18627 525 aa22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 DDIT3P35638 169 aa22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 MAPK7Q13164 816 aa22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 POLD4Q9HCU8 107 aa22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.08■■□□□ 1.13
CAVIN3-201ENST00000303927 TCHHQ07283 1943 aa22.08■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 PER2O15055 1255 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 CUTAO60888 179 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 PEX3P56589 373 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 ERVFC1P60507 584 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 MCM6Q14566 821 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 UBXN11Q5T124 520 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 GPBP1Q86WP2 473 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 RNF135Q8IUD6 432 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 LRRC15Q8TF66 581 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 CPB2Q96IY4 423 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 CASD1Q96PB1 797 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 RNF19AQ9NV58 838 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 A0A1B0GUA9 196 aa22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC169A6NNP5 214 aa22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 ACKR2O00590 384 aa22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 PRKCBP05771 671 aa22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 NPTX2P47972 431 aa22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 LRRC43Q8N309 656 aa22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAVIN3-201ENST00000303927 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms