RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNB1Q14721 858 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 STXBP2Q15833 593 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEB5Q9BZ81 275 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM49P0CI25 452 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM49CP0CI26 452 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 MS4A14Q96JA4 679 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 AGTP01019 485 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNA8P32881 189 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 BCAR1P56945 870 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 GGT7Q9UJ14 662 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 PHKA2P46019 1235 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 NCAPD2Q15021 1401 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TDP2O95551 362 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ESRRBO95718 433 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CRKP46108 304 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 WWP1Q9H0M0 922 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 IRAK4Q9NWZ3 460 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 EMSYQ7Z589 1322 aa25.61■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SYF2O95926 243 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 PGM1P36871 562 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 LRIG3Q6UXM1 1119 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 PARVAQ9NVD7 372 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 NEO1Q92859 1461 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 HDAC4P56524 1084 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 HUS1O60921 280 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM94Q12767 1356 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GTH6 734 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ASNSP08243 561 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CHN1P15882 459 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 HIC1Q14526 733 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TRABDQ9H4I3 376 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF302Q9NR11 478 aa25.6■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TYK2P29597 1187 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT33BQ14525 404 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKMY2Q8IV38 441 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ULK4Q96C45 1275 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 COG4Q9H9E3 785 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SFNP31947 248 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SZRD1Q7Z422 152 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 LXNQ9BS40 222 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2C19P33261 490 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 GPD1LQ8N335 351 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 BEST2Q8NFU1 509 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 DACH2Q96NX9 599 aa25.59■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3R2O00459 728 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RTN2O75298 545 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 HIF1AQ16665 826 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SH2D3CQ8N5H7 860 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR162Q16538 588 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RHPN2Q8IUC4 686 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 STAP1Q9ULZ2 295 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPRE2Q15555 327 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC31Q6UY01 552 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 MTBPQ96DY7 904 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.58■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.58■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 BFARQ9NZS9 450 aa25.58■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SENP1Q9P0U3 644 aa25.58■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ6P48051 423 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 TAP1Q03518 808 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.57■■□□□ 1.68
GNPTAB-201ENST00000299314 CSPG5O95196 566 aa25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms