RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299084.8

SPRED1-201, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRED1, Length 7,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1-201ENST00000299084 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 LUZP2Q86TE4 346 aa15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 TTC17Q96AE7 1141 aa15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SREBF2Q12772 1141 aa15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 LAMB3Q13751 1172 aa15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ZNF394Q53GI3 561 aa15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 TTC13Q8NBP0 860 aa15.18■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 PSMD14O00487 310 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ZNF302Q9NR11 478 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 KRT38O76015 456 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 TWF1Q12792 350 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 EPN3Q9H201 632 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 DCTPP1Q9H773 170 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SYBUQ9NX95 663 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 CALB1P05937 261 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SPATA18Q8TC71 538 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ATP10BO94823 1461 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 RFX3P48380 749 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 RMDN3Q96TC7 470 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 IL10P22301 178 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 PLCL1Q15111 1095 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ARL4CP56559 192 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 FAM47EQ6ZV65 393 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 TTC39CQ8N584 583 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ADORA2BP29275 332 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 COMMD2Q86X83 199 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 TESK2Q96S53 571 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 LRRC14BA6NHZ5 514 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 CFAP99D6REC4 459 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 NDUFS3O75489 264 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 VPS50Q96JG6 964 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC3Q9BQI4 270 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SLC39A10Q9ULF5 831 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 CAPN1P07384 714 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 OTUD5Q96G74 571 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 PARVBQ9HBI1 364 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 GID8Q9NWU2 228 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 H0Y3Z8 333 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 PPP6R2O75170 966 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 JAK1P23458 1154 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 RAB14P61106 215 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ZNF560Q96MR9 790 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 BRD8Q9H0E9 1235 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 GYG2O15488 501 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 LCP1P13796 627 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 GUCY1A2P33402 732 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 MCPH1Q8NEM0 835 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 KIF12Q96FN5 646 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SESN1Q9Y6P5 492 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 C21orf2O43822 256 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 KRT84Q9NSB2 600 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SPASTQ9UBP0 616 aa15.16■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 RGS2P41220 211 aa15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 SEPT2Q15019 361 aa15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 PASD1Q8IV76 773 aa15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 FEM1BQ9UK73 627 aa15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ASXL2Q76L83 1435 aa15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.15■□□□□ 0.02
SPRED1-201ENST00000299084 ASAP2O43150 1006 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms