RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CTNNA2P26232 953 aa30.17■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PMS2P54278 862 aa30.17■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 GLG1Q92896 1179 aa30.17■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 TIPINQ9BVW5 301 aa30.17■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 WNT8AQ9H1J5 351 aa30.17■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 C5orf60A6NFR6 353 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 USP8P40818 1118 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PTGIRP43119 386 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PLCB4Q15147 1175 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 SPDYE2Q495Y8 402 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 C1orf220Q5T0J3 134 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 FBXO41Q8TF61 875 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 IWS1Q96ST2 819 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 KCNH7Q9NS40 1196 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 HSPBP1Q9NZL4 362 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 TMOD1P28289 359 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 GCLMP48507 274 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 TGFB2P61812 414 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 CROCCP2Q86T23 111 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 NIM1KQ8IY84 436 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 OGFOD1Q8N543 542 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 CENPTQ96BT3 561 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 RUNDC3BQ96NL0 473 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 CBWD1Q9BRT8 395 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ZHX2Q9Y6X8 837 aa30.16■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 CNTNAP1P78357 1384 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 CLRN2A0PK11 232 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 LYPLA2O95372 231 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 COPB2P35606 906 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 RARRES1P49788 294 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 GTF2BQ00403 316 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 SEL1L2Q5TEA6 688 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC24Q6UX98 284 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 RAPGEF5Q92565 580 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 EPB41L4BQ9H329 900 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 MXI1P50539 228 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 DENND2CQ68D51 928 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 FAM71AQ8IYT1 594 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PRELID2Q8N945 189 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PGM2Q96G03 612 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PIM2Q9P1W9 311 aa30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 DCDC2CA8MYV0 355 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 DHX15O43143 795 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PEX5P50542 639 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 PLTPP55058 493 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 IFT88Q13099 833 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 MAEAQ7L5Y9 396 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 SLC17A8Q8NDX2 589 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 EPS8L1Q8TE68 723 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 KRT35Q92764 455 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 C18orf8Q96DM3 657 aa30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
UBP1-201ENST00000283628 CCDC169A6NNP5 214 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 H0YHG0 523 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 ICAM1P05362 532 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 QARSP47897 775 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 GRHL1Q9NZI5 618 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 SNX24Q9Y343 169 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 TISP43B9A030 160 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D12O60347 775 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 COMTP21964 271 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 FBXW10Q5XX13 1052 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 HAUS6Q7Z4H7 955 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 FBXO25Q8TCJ0 367 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 CD101Q93033 1021 aa30.13■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 CHRNB2P17787 502 aa30.12■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 CYP1B1Q16678 543 aa30.12■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 FAM129AQ9BZQ8 928 aa30.12■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 TMEM117Q9H0C3 514 aa30.12■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 CCPG1Q9ULG6 757 aa30.12■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 CAND2O75155 1236 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 PTGER2P43116 358 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 PCDHB18PQ96TA0 734 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 FBXO28Q9NVF7 368 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 MTUS1Q9ULD2 1270 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 SGPL1O95470 568 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 ALAS1P13196 640 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 MARCKSL1P49006 195 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 MFAP3P55082 362 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 MESDQ14696 234 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 AADACL2Q6P093 401 aa30.11■■■□□ 2.41
UBP1-201ENST00000283628 CCDC121Q6ZUS5 278 aa30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms