RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.77■■□□□ 1.56
UFD1-201ENST00000263202 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.76■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.76■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 MAPK13O15264 365 aa24.76■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 AMHR2Q16671 573 aa24.76■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 FBXL18Q96ME1 805 aa24.76■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.76■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 B4GALT5O43286 388 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 LBX1P52954 281 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 DEFB118Q96PH6 123 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 RNF208Q9H0X6 261 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 A0A0B4J269 797 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 A0A1W2PQY0 241 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TOM1L1O75674 476 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 SERINC5Q86VE9 423 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 GPD1LQ8N335 351 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 SLC35C1Q96A29 364 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PHF24Q9UPV7 400 aa24.75■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 A0A1W2PQC6 194 aa24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 KBTBD13C9JR72 458 aa24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 KCNH2Q12809 1159 aa24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 GINS2Q9Y248 185 aa24.74■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ABLIM1O14639 778 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ADRB2P07550 413 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PROZP22891 400 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 BFSP1Q12934 665 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 OSMRQ99650 979 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.73■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 DNM1LO00429 736 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CLDN3O15551 220 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 EXTL3O43909 919 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PTGISQ16647 500 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 WNT8BQ93098 351 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 KRT13P13646 458 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 MCL1Q07820 350 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.72■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TSPAN1O60635 241 aa24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 RPAINQ86UA6 219 aa24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TCHPQ9BT92 498 aa24.71■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ERLIN2O94905 339 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 FGFR4P22455 802 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 VAMP7P51809 220 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 SYCP1Q15431 976 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 ZBTB33Q86T24 672 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 RSPH3Q86UC2 560 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.7■■□□□ 1.55
UFD1-201ENST00000263202 BRCA2P51587 3418 aa24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms