RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8KD6RF30 607 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YGN5 161 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX3O15119 743 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SRGAP2O75044 1071 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPZA3Q96KX2 299 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TOX2Q96NM4 488 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR64B1ANS9 1081 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 OPA1O60313 960 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF8P28908 595 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ALS2CR12Q96Q35 445 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 EDEM3Q9BZQ6 932 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM9Q9C026 710 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AZI2Q9H6S1 392 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF302Q9NR11 478 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 KAT6AQ92794 2004 aa28.64■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 DCDC2CA8MYV0 355 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF862O60290 1169 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 GGCXP38435 758 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R5CQ13362 524 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCB4Q15147 1175 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CABP7Q86V35 215 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CLTBP09497 229 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 MIIPQ5JXC2 388 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEMA6NI47 508 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PSAPP07602 524 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PPFIA1Q13136 1202 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ALS2CLQ60I27 953 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD40Q6AI12 368 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 EMBQ6PCB8 327 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CREG2Q8IUH2 290 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SLFN12Q8IYM2 578 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 BANK1Q8NDB2 785 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT8BQ93098 351 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF14Q9UBS8 474 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6CA6NDK9 693 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RCCD1A6NED2 376 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6DP0CG33 693 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGISQ16647 500 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SESTD1Q86VW0 696 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RGL1Q9NZL6 768 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM150BA6NC51 233 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TREHO43280 583 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CPP00450 1065 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52Z1P0C646 297 aa28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-201ENST00000246533 TECP42680 631 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 NNTQ13423 1086 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX21Q9UL17 535 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 HYOU1Q9Y4L1 999 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 AGPSO00116 658 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCG1P19174 1290 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHB4P54760 987 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 IGBP1P78318 339 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PJA2O43164 708 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 INSRRP14616 1297 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 JAK3P52333 1124 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPPQ6IPU0 288 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3GL2Q99962 352 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPC6Q9Y210 931 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 NR2E3Q9Y5X4 410 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEB3A0JP26 581 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXC8P31273 242 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SFNP31947 248 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ASIC1P78348 528 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXR1Q6PIV2 292 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEBQ6S5H4 581 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 MACROD2A1Z1Q3 448 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM17P78536 824 aa28.58■■■□□ 2.17
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