RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP7Q8WX94 980 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PGBD1Q96JS3 809 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 CHRDQ9H2X0 955 aa18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH2P05091 517 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TRDNQ13061 729 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LILRA6Q6PI73 481 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 AGMOQ6ZNB7 445 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PALB2Q86YC2 1186 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 URGCPQ8TCY9 931 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FGF13Q92913 245 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 KXD1Q9BQD3 176 aa18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZMYND10O75800 440 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 DDAH1O94760 285 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NTHL1P78549 312 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FAM167AQ96KS9 214 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LZTS2Q9BRK4 669 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PHF20Q9BVI0 1012 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ANO3Q9BYT9 981 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IL25Q9H293 177 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ANTXR2P58335 489 aa18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 DRP2Q13474 957 aa18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SART3Q15020 963 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 MBOAT7Q96N66 472 aa18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IER2Q9BTL4 223 aa18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 CHST7Q9NS84 486 aa18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FAM86B1E9PN63 330 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 SREBF1P36956 1147 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PGBD4Q96DM1 585 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 RSAD1Q9HA92 442 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 VWA8A3KMH1 1905 aa18.52■□□□□ 0.56
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 F8W810 466 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 HRO43593 1189 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF862O60290 1169 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 KCNK5O95279 499 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R5DQ14738 602 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 ITFG1Q8TB96 612 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 B3GALT6Q96L58 329 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 RXFP3Q9NSD7 469 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 FNIP2Q9P278 1114 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 FBXW11Q9UKB1 542 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.51■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 EML5Q05BV3 1969 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WZ62 844 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 POMCP01189 267 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 OATP04181 439 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 PSAPP07602 524 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 CYP21A2P08686 494 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 GNAQP50148 359 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 CCR3P51677 355 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 TYW1BQ6NUM6 668 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 GPR65Q8IYL9 337 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 WASF3Q9UPY6 502 aa18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 NAV2Q8IVL1 2488 aa18.49■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SPCS1-201ENST00000233025 FOSP01100 380 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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