RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226382.3

PHOX2B-201, Transcript of paired like homeobox 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHOX2B, Length 3,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2B-201ENST00000226382 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 PTGIRP43119 386 aa22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 MYL7Q01449 175 aa22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 HYIQ5T013 277 aa22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 PHLPP1O60346 1717 aa22.16■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 GJC1P36383 396 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 NFIAQ12857 509 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 MPP2Q14168 576 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 FITM2Q8N6M3 262 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 GPR88Q9GZN0 384 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 NENFQ9UMX5 172 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 AGTP01019 485 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 PDE6CP51160 858 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 CALCOCO2Q13137 446 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 GRAPQ13588 217 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF570Q96NI8 536 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 MEIS2O14770 477 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 MSH4O15457 936 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 FAM163BP0C2L3 166 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 RPA1P27694 616 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 SMARCA1P28370 1054 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 NARFQ9UHQ1 456 aa22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.14■■□□□ 1.14
PHOX2B-201ENST00000226382 H0Y3Z8 333 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 EPC2Q52LR7 807 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ODR4Q5SWX8 454 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 DYDC2Q96IM9 177 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 TMEM237Q96Q45 408 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ANKRD62A6NC57 917 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 MAFGO15525 162 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ICA1Q05084 483 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SAAL1Q96ER3 474 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 AGPAT1Q99943 283 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.14■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 AFF2P51816 1311 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 FAM187AA6NFU0 413 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 BRAFP15056 766 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ITIH4Q14624 930 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 CENPTQ96BT3 561 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 GGA1Q9UJY5 639 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 GDF11O95390 407 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SNHG28P0DPA3 235 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 STX2P32856 288 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 CYP4X1Q8N118 509 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 CNBD1Q8NA66 436 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SUN1O94901 812 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ABCD1P33897 745 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 DOK7Q18PE1 504 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SPOCK2Q92563 424 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 P3H4Q92791 437 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 C9orf72Q96LT7 481 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF232Q9UNY5 417 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SPAG7O75391 227 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SGPL1O95470 568 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SHMT1P34896 483 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 SLFN13Q68D06 897 aa22.12■■□□□ 1.13
PHOX2B-201ENST00000226382 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms