RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 ERO1BQ86YB8 467 aa13.56□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TMEM143Q96AN5 459 aa13.56□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CDCA5Q96FF9 252 aa13.56□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 MFSD14AQ96MC6 490 aa13.56□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 PCYT2Q99447 389 aa13.56□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.56□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 USP20Q9Y2K6 914 aa13.56□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC172P0C7W6 258 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TNFAIP3P21580 790 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ASAP3Q8TDY4 903 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ZBTB9Q96C00 473 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 IFT74Q96LB3 600 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 KREMEN1Q96MU8 473 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CEP89Q96ST8 783 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 AGPAT1Q99943 283 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 RNF14Q9UBS8 474 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 KIF4AO95239 1232 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 MCM3P25205 808 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CYP24A1Q07973 514 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CASP8Q14790 479 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 RPS6KA1Q15418 735 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 KRT39Q6A163 491 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 EEPD1Q7L9B9 569 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 SLFN11Q7Z7L1 901 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 FAM84AQ96KN4 292 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 OSGEPQ9NPF4 335 aa13.55□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 NCANO14594 1321 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CXCL11O14625 94 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TMEM253P0C7T8 217 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ABCB4P21439 1286 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 SLC7A5Q01650 507 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 MOGSQ13724 837 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 GPD1LQ8N335 351 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TMC2Q8TDI7 906 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TAS1R2Q8TE23 839 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ELMO3Q96BJ8 720 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ARHGEF26Q96DR7 871 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 BICD1Q96G01 975 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TMEM8AQ9HCN3 771 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.54□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 H3BQF6 201 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 KCNK3O14649 394 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 PGK2P07205 417 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 GARTP22102 1010 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 GLRA2P23416 452 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 OAS2P29728 719 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 Q3C1V9 767 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 SLC35G2Q8TBE7 412 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 FGD4Q96M96 766 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 FAM213AQ9BRX8 229 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 THAP2Q9H0W7 228 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 PORCNQ9H237 461 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 SGPL1O95470 568 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 DLATP10515 647 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ARL2P36404 184 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 USP8P40818 1118 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 GPC3P51654 580 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 LY6KQ17RY6 165 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC70Q6NSX1 233 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 FAM71AQ8IYT1 594 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 HELQQ8TDG4 1101 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 RFFLQ8WZ73 363 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TAF4BQ92750 862 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ACP6Q9NPH0 428 aa13.53□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 ARIH2O95376 493 aa13.52□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 TERF2Q15554 542 aa13.52□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 SV2AQ7L0J3 742 aa13.52□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa13.52□□□□□ -0.24
PTGS1-201ENST00000223423 HAPLN2Q9GZV7 340 aa13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms