RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 CPB2Q96IY4 423 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-201ENST00000222305 CEP63Q96MT8 703 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-201ENST00000222305 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-201ENST00000222305 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-201ENST00000222305 DMAC2Q9NW81 257 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-201ENST00000222305 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.15■■□□□ 1.62
USF2-201ENST00000222305 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.14■■□□□ 1.62
USF2-201ENST00000222305 TSPAN1O60635 241 aa25.14■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CD4P01730 458 aa25.14■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.14■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TANC1Q9C0D5 1861 aa25.14■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 AKAP3O75969 853 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CKBP12277 381 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TRIM60Q495X7 471 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ATF7IP2Q5U623 682 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 SAAL1Q96ER3 474 aa25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 EXOC3O60645 756 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 GARTP22102 1010 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 STYXL1Q9Y6J8 313 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TOM1L1O75674 476 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FANCCQ00597 558 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 EEF1DP3Q658K8 133 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ZBTB33Q86T24 672 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 RDH13Q8NBN7 331 aa25.12■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ANK1P16157 1881 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 SCN5AQ14524 2016 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ABLIM1O14639 778 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 MYBPC2Q14324 1141 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 KRT31Q15323 416 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FAM26DQ5JW98 314 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FAM228AQ86W67 206 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.11■■□□□ 1.61
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USF2-201ENST00000222305 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 PTPRHQ9HD43 1115 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TNFSF13BQ9Y275 285 aa25.11■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CLDN3O15551 220 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CAND2O75155 1236 aa25.1■■□□□ 1.61
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USF2-201ENST00000222305 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 MPZL3Q6UWV2 235 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ALPK3Q96L96 1907 aa25.1■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 A0A0B4J269 797 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TLE2Q04725 743 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CAGE1Q8TC20 777 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 ABHD8Q96I13 439 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.09■■□□□ 1.61
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USF2-201ENST00000222305 CITO14578 2027 aa25.09■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 RPS6KA5O75582 802 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 GNA14O95837 355 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 GHRP10912 638 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 CAPN2P17655 700 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FAAP100Q0VG06 881 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.612e-6■■■■□ 23
USF2-201ENST00000222305 LRRC26Q2I0M4 334 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.08■■□□□ 1.61
USF2-201ENST00000222305 SARM1Q6SZW1 724 aa25.08■■□□□ 1.61
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