RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ICAM3P32942 547 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 VAMP7P51809 220 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PDE4CQ08493 712 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GRB14Q14449 540 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TLK2Q86UE8 772 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CD99L2Q8TCZ2 262 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 NLRP7Q8WX94 980 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM117Q9H0C3 514 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 KLK14Q9P0G3 267 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TRIP11Q15643 1979 aa7.16□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ATG7O95352 703 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CD58P19256 250 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 GTF2BQ00403 316 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SV2AQ7L0J3 742 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA1328Q86T90 577 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF185O15231 689 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CFHP08603 1231 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 SLC10A3P09131 477 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 MAP2K5Q13163 448 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 BORCS6Q96GS4 357 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 COL6A3P12111 3177 aa7.15□□□□□ -1.26
CNIH1-201ENST00000216416 ASB14A6NK59 587 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NRDCO43847 1150 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KRT19P08727 400 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TGFB3P10600 412 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KIF11P52732 1056 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PASD1Q8IV76 773 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 STRA6Q9BX79 667 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NFASCO94856 1347 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MOCS3O95396 460 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC175P0C221 793 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CXCL8P10145 99 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 YY1P25490 414 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZBED6P86452 979 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 STRN3Q13033 797 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PPFIA1Q13136 1202 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 NEK9Q8TD19 979 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 WNT8BQ93098 351 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SIX2Q9NPC8 291 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MORF4L1Q9UBU8 362 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GJD2Q9UKL4 321 aa7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PASKQ96RG2 1323 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PIK3R2O00459 728 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CLDN3O15551 220 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 LYPLA2O95372 231 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 GH1P01241 217 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KRT13P13646 458 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 AKAP5P24588 427 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MXI1P50539 228 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 HGSNATQ68CP4 663 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 RNF169Q8NCN4 708 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.14□□□□□ -1.27
CNIH1-201ENST00000216416 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms