RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 KREMEN1Q96MU8 473 aa18.69■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.69■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.69■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 PXMP2Q9NR77 195 aa18.69■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa18.69■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 TBX20Q9UMR3 447 aa18.69■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SGPL1O95470 568 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 DPEP1P16444 411 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 HSPA6P17066 643 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 LSP1P33241 339 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 DR1Q01658 176 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 XKR9Q5GH70 373 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 UBL4BQ8N7F7 174 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MORC4Q8TE76 937 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 RMDN3Q96TC7 470 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ERP44Q9BS26 406 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 TXLNGYQ9BZA5 131 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 PPFIA2O75334 1257 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MDH1P40925 334 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SMTNP53814 917 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MFAP3P55082 362 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 NAA35Q5VZE5 725 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 XRRA1Q6P2D8 792 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 CBWD2Q8IUF1 395 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 PARD3BQ8TEW8 1205 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SENP7Q9BQF6 1050 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 EPN3Q9H201 632 aa18.68■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD63C9JTQ0 380 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MYO1FO00160 1098 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 FDX1P10109 184 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 CNGA1P29973 690 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 NPTX2P47972 431 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 PEX5P50542 639 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 GPC3P51654 580 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 GUCY1A3Q02108 690 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 KRT39Q6A163 491 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ANO5Q75V66 913 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 TMC2Q8TDI7 906 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SEMA4DQ92854 862 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 FBXL18Q96ME1 805 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ZSWIM1Q9BR11 485 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.67■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 AGBL2Q5U5Z8 902 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 KRT35Q92764 455 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 DPH5Q9H2P9 285 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM8AQ9HCN3 771 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 CYP26A1O43174 497 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ZBED4O75132 1171 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 CYP1A2P05177 515 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 USP8P40818 1118 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 DGKZQ13574 1117 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SKIDA1Q1XH10 827 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 PPM1KQ8N3J5 372 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 HELQQ8TDG4 1101 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 CD101Q93033 1021 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MFSD14AQ96MC6 490 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 FMO2Q99518 471 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 WNT8AQ9H1J5 351 aa18.66■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFAB1O14561 156 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 GGPS1O95749 300 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 COMTP21964 271 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 RXRBP28702 533 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 GTF2H1P32780 548 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 FMO1Q01740 532 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 ENPEPQ07075 957 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 TNFAIP1Q13829 316 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 PTGISQ16647 500 aa18.65■□□□□ 0.58
CLDN11-201ENST00000064724 SLC47A2Q86VL8 602 aa18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms