RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf6Q9DBU5 667 aa24.27■■□□□ 1.48
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tacc3Q9JJ11 631 aa24.27■■□□□ 1.48
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mta2Q9R190 668 aa24.27■■□□□ 1.48
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fem1bQ9Z2G0 627 aa24.27■■□□□ 1.48
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Unc13dB2RUP2 1085 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 VimP20152 466 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prom2Q3UUY6 835 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Senp6Q6P7W0 1132 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RalylQ8BTF8 293 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Unc5bQ8K1S3 945 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gimap4Q99JY3 219 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MlxiplQ99MZ3 864 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lman1Q9D0F3 517 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Xrcc5P27641 732 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Erich4Q3UNU4 136 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm10488Q4KL05 212 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp341Q6PGC9 846 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SpopQ6ZWS8 374 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm5622Q810Q0 167 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fsd1lQ8BYN5 507 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Calcoco1Q8CGU1 691 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa24.26■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4933406M09RikG3XA12 479 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4930544D05RikJ3QK56 214 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GabpaQ00422 454 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc125Q5U465 500 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FancbQ5XJY6 703 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q8BGN9 141 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TbckQ8BM85 762 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Iws1Q8C1D8 766 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Apol9bQ8C7I4 310 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fbxo43Q8CDI2 640 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Apol9aQ8VDU3 310 aa24.25■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Proca1B0QZF7 307 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mdm4O35618 489 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc39dQ0VF76 604 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tex35Q14BK3 207 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Miga1Q4QQM5 600 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bicd1Q8BR07 835 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PycardQ9EPB4 193 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm4758L7N258 96 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AfpP02772 605 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AdssP46664 456 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mtus1Q5HZI1 1210 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pla2g4cQ64GA5 597 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm2163Q6PCY5 473 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tarsl2Q8BLY2 790 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trmt10bQ9D075 318 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm31yQ9D3U4 565 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Capn12Q9ER56 720 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf4Q9QZS2 194 aa24.24■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Camkk2Q8C078 588 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 C130026I21RikQ8C898 291 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CalcbQ99MP3 130 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttll6A4Q9E8 822 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eddm13E9Q7F5 164 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdc25cP48967 447 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Commd10Q8JZY2 202 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cpb2Q9JHH6 422 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt71Q9R0H5 524 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lamb2Q61292 1799 aa24.23■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr247E9PVJ7 320 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr552E9Q545 317 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myo1eE9Q634 1107 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr819K7N727 320 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gpd2Q64521 727 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Efl1Q8C0D5 1127 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klhl11Q8CE33 709 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Xpo6Q924Z6 1125 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sppl3Q9CUS9 384 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olr1Q9EQ09 363 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d16A2ABG4 766 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Flot1O08917 428 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atp9aO70228 1047 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Shox2P70390 331 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cypt2Q6P924 180 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dusp4Q8BFV3 398 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mageb18Q8BQR7 327 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hook3Q8BUK6 718 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf704Q9ERQ3 566 aa24.22■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Psmc5P62196 406 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tex11Q14AT2 947 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr41Q3UDP0 460 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Syne3Q4FZC9 975 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atg4cQ811C2 458 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem161bQ8C2L6 487 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Snapc2Q91XA5 359 aa24.21■■□□□ 1.47
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.5 ms