RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Alkbh1P0CB42 389 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Il2rbP16297 539 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Atp8b1Q148W0 1251 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Olfm4Q3UZZ4 505 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 FancbQ5XJY6 703 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pacsin1Q61644 441 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slain1Q68FF7 579 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 IgflQ6B9Z0 140 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mtmr10Q7TPM9 771 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Q8BGN9 141 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lrrc24Q8BHA1 521 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tcaf1Q8BNE1 924 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 AsphQ8BSY0 741 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc38a7Q8BWH0 463 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gtpbp10Q8K013 366 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Olfr390Q8VEZ7 311 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nmrk1Q91W63 195 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sv2aQ9JIS5 742 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Uchl3Q9JKB1 230 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm7086A0A1W2P766 342 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Skor2A7M7C7 1008 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Clca3bE9PUL3 1044 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 GclmO09172 274 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Enc1O35709 589 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Apba3O88888 571 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cxcl9P18340 126 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gfpt1P47856 697 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nat8lQ3UGX3 299 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ItgadQ3V0T4 1168 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyp3a11Q64459 504 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gba2Q69ZF3 918 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tlr11Q6R5P0 926 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Znf507Q6ZPY5 941 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Naa15Q80UM3 865 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fbxo43Q8CDI2 640 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mamdc2Q8CG85 686 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mmgt1Q8K273 131 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sgip1Q8VD37 806 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ubxn6Q99PL6 442 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zfp623Q9CY99 499 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Limd1Q9QXD8 668 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 EcsitQ9QZH6 435 aa10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm13084A2A8N0 494 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm14525B1AZA0 212 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm2012B1B0R1 212 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc4a9E9PUP3 929 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zfp266E9Q2S7 604 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trdmt1O55055 415 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 AfmO89020 608 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mt-CybP00158 381 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 TxkP42682 527 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cdc25cP48967 447 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Morf4l1P60762 362 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Miga1Q4QQM5 600 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm14819Q62478 212 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ece2Q80Z60 881 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tdp1Q8BJ37 609 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc28aQ8CEI3 192 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Plcb4Q91UZ1 1175 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dnajc17Q91WT4 303 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fgd4Q91ZT5 766 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sppl3Q9CUS9 384 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Castor1Q9CWQ8 331 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pdk2Q9JK42 407 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nudt5Q9JKX6 218 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gyg1Q9R062 333 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Adam22Q9R1V6 904 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Brca1P48754 1812 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm4297D3YWB7 211 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc152E9PX14 254 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tmod1P49813 359 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 CiitaP79621 1155 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Grm1P97772 1199 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cul4aQ3TCH7 759 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc125Q5U465 500 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 LbpQ61805 481 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Q66JV7 365 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rnf139Q7TMV1 668 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fgd5Q80UZ0 1219 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ankfy1Q810B6 1169 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rint1Q8BZ36 792 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krt222Q8CCX5 294 aa10.07□□□□□ -0.8
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Il17cQ8K4C5 194 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.2 ms