RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rsrc1Q9DBU6 334 aa10.04□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam171a1A2ATK9 892 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm6583E9Q8Z1 469 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Svs3aF2Z472 265 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zscan2Q07230 614 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam81aQ3UXZ6 364 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LdhdQ7TNG8 484 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PhkbQ7TSH2 1085 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gprc5cQ8K3J9 440 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nxnl2Q9D531 156 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nudt12Q9DCN1 462 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abca15E9PWH4 1668 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gli3Q61602 1583 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wdr72D3YYM4 1114 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc16a2O70324 545 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rasgrf1P27671 1262 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klra4Q60651 263 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ugt1a9Q62452 528 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rab34Q64008 259 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 GmipQ6PGG2 971 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ttc7aQ8BGB2 858 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Elmo3Q8BYZ7 720 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Epc2Q8C0I4 808 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pnma1Q8C1C8 353 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Flt1P35969 1333 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm7995L7N2E4 160 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tex11Q14AT2 947 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cnga4Q3UW12 575 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ndufaf2Q59J78 168 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q6DFW0 481 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q8BGD0 127 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PreplQ8C167 725 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf467Q8JZL0 594 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vps37bQ8R0J7 285 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trpm8Q8R4D5 1104 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rexo2Q9D8S4 237 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ErmapQ9JLN5 566 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rabgef1Q9JM13 491 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pdcd7Q9WTY1 482 aa10.03□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PtenO08586 403 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rgs9bpQ148R9 237 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trmt1Q3TX08 663 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SkiQ60698 725 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nr2e1Q64104 385 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sec23ipQ6NZC7 998 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PrimpolQ6P1E7 537 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q8BGN9 141 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Actl9Q8CG27 415 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc51aQ8R000 340 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nrbp2Q91V36 499 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Borcs6Q9D6W8 360 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 IkbipQ9DBZ1 373 aa10.02□□□□□ -0.8
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Myh13B1AR69 1938 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mmrn2A6H6E2 943 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MyocO70624 490 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmem120bQ3TA38 339 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wnk4Q80UE6 1222 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atg4cQ811C2 458 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AarsQ8BGQ7 968 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 DcakdQ8BHC4 231 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Armc6Q8BNU0 468 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ttc8Q8VD72 515 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ptf1aQ9QX98 324 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rnf103Q9R1W3 683 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gbp2Q9Z0E6 589 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10436L7N1Y3 520 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pja1O55176 578 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rit2P70425 217 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Runx2Q08775 607 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Syne3Q4FZC9 975 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppm1kQ8BXN7 372 aa10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Noc2lQ9WV70 747 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gimd1E9PW74 217 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm3182K7N6T8 263 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mt-CybP00158 381 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Msh3P13705 1091 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gja5Q01231 358 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Brd9Q3UQU0 596 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 GmncQ3URY2 333 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Apol9bQ8C7I4 310 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Uba6Q8C7R4 1053 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrc8cQ8R502 803 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Apol9aQ8VDU3 310 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nr3c2Q8VII8 978 aa10.01□□□□□ -0.81
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Krt20Q9D312 431 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms