RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W YIR020CP40575 100 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W MND2P40577 368 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W AZF1P41696 914 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W AGP3P43548 558 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W PNC1P53184 216 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W OSH6Q02201 448 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W SPO19Q03029 223 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W VPS74Q06385 345 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W MHF2Q3E829 80 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W YLL053CP0CD98 152 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W CSM1P25651 190 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W PPA2P28239 310 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W SEC1P30619 724 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W IAH1P41734 238 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W NCE103P53615 221 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W DFG16Q99234 619 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W YNK1P36010 153 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W RFC2P40348 353 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W STB1P42845 420 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W COS10P52924 374 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W URC2Q04411 772 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W RIF2Q06208 395 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W INP53Q12271 1107 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W RAD7P06779 565 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W SPO12P17123 173 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W LAC1P28496 418 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W ASK1P35734 292 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W RTC2P38279 296 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W PRS2P38620 318 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W SCC4P40090 624 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W COG2P53271 262 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W YMR102CQ03177 834 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W EKI1Q03764 534 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W CAB5Q03941 241 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W TSA2Q04120 196 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W CAC2Q04199 468 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W IPK1Q06667 281 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W YLL007CQ07799 665 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W RBK1P25332 333 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W RFA2P26754 273 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W KAR9P32526 644 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W MSN2P33748 704 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W PHB2P50085 310 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W YNL046WP53956 172 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W PRM3Q08931 133 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W ADE1P27616 306 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W MET22P32179 357 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W SUR2P38992 349 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W YER085CP40058 173 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W COG3P40094 801 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W YPR091CQ06833 770 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W PTC1P35182 281 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W APL3P38065 1025 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W YEL028WP39989 153 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W TRS85P46944 698 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W EMC4P53073 190 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W ESBP6P53918 673 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W ASM4Q05166 528 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W VIK1Q12045 647 aa2.54□□□□□ -2
SIN3YOL004W ALG1P16661 449 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W RNA14P25298 677 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W TIF3P34167 436 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W EFM2P38347 419 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W VHS2P40463 436 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W FMP16Q12497 93 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data2.53□□□□□ -2 RIP-Chip
SIN3YOL004W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W SAT4P25333 603 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W RRN10P38204 145 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W SDH8P38345 138 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W TRM5P38793 499 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W ALP1P38971 573 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W RFX1P48743 811 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W MDM34P53083 459 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W BUD32P53323 261 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W DSL1P53847 754 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W SYO1Q07395 620 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W FDH1Q08911 376 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W COX5AP00424 153 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W TMA19P35691 167 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W SHO1P40073 367 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W COX15P40086 486 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W MSS2P40990 351 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W MOB2P43563 287 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W GMC2Q06201 188 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W TPO3Q06451 622 aa2.53□□□□□ -2
SIN3YOL004W RAD34Q06665 692 aa2.53□□□□□ -2
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