RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	PMT2	P31382	759 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	MNN2	P38069	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	IST2	P38250	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YHC3	P47040	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	SLG1	P54867	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	DAP2	P18962	818 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	UTR1	P21373	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	SRB6	P32570	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
DNF2	YDR093W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
DNF2	YDR093W	MOD5	P07884	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	CTS1	P29029	562 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	SIP1	P32578	815 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	RIB7	P33312	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	FRE2	P36033	711 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	MSS4	P38994	779 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	ERV46	P39727	415 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YEL073C	P39974	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	IRC24	P40580	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	RPE1	P46969	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	AVT4	P50944	713 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YNR062C	P53748	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YML108W	Q03759	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	SOD2	P00447	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	FLP1	P03870	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	COQ2	P32378	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YPS6	P40583	537 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	HMS2	P47175	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	MET32	Q12041	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	MRS4	P23500	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	LSB5	P25369	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	GUT2	P32191	649 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	SOL2	P37262	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	RRG9	P40156	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	ARR1	Q06596	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	TEN1	Q07921	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	NSI1	Q12457	570 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	SPS2	P08459	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	ARO7	P32178	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	YKL077W	P36081	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	GLC8	P41818	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	ASI2	P53895	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	INP1	Q03694	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	PIN2	Q12057	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	JID1	Q12350	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DNF2	YDR093W	CDC7	P06243	507 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	HEM15	P16622	393 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	PPH21	P23594	369 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	MDJ2	P42834	146 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	MNN5	P46982	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	SCS3	P53012	380 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	PRM8	P53174	237 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	SAY1	P53324	424 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	ERV29	P53337	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	HPF1	Q05164	967 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	OCA4	P25366	362 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	TRS65	P32893	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	SCO2	P38072	301 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	YJR120W	P47157	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	FMP48	P53233	369 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	ALG12	P53730	551 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	YNR064C	P53750	290 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	YAT1	P80235	687 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DNF2	YDR093W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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