RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CES5AQ6NT32 575 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FERMT3Q86UX7 667 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TPH2Q8IWU9 490 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRSS33Q8NF86 280 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TCP11Q8WWU5 503 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WASF1Q92558 559 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GTF3C6Q969F1 213 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PGBD4Q96DM1 585 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ASIC4Q96FT7 647 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MTRQ99707 1265 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RNF39Q9H2S5 420 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RSAD1Q9HA92 442 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PPME1Q9Y570 386 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NRP1O14786 923 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ASAP2O43150 1006 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TSPAN1O60635 241 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 JAK2O60674 1132 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERLIN2O94905 339 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ALDH2P05091 517 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NEFLP07196 543 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TXKP42681 527 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRE11P49959 708 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PTENP60484 403 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ITIH3Q06033 890 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CAPSQ13938 189 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PTPN14Q15678 1187 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CALCRLQ16602 461 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBXL6Q8N531 539 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 URGCPQ8TCY9 931 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CPB2Q96IY4 423 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PHOX2BQ99453 314 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNH6Q9H252 994 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MARCH5Q9NX47 278 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MIOSQ9NXC5 875 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NR2E1Q9Y466 385 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HES2Q9Y543 173 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IPPQ9Y573 584 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IRAK3Q9Y616 596 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CARNS1A5YM72 827 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POTEMA6NI47 508 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 F8W810 466 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 B4GALT5O43286 388 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NEMFO60524 1076 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LILRB3O75022 631 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LYPLA2O95372 231 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SEC24BO95487 1268 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ASGR2P07307 311 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ITGA4P13612 1032 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATP2B1P20020 1258 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GLRA2P23416 452 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KLRC2P26717 231 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARL2P36404 184 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MLH1P40692 756 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MTHFRP42898 656 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR1G1P47890 313 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RARRES1P49788 294 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms