RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OGFOD1	Q8N543	542 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMEM87B	Q96K49	555 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAGEB18	Q96M61	343 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PHF12	Q96QT6	1004 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERP44	Q9BS26	406 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SYNC	Q9H7C4	482 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FLT4	P35916	1363 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAPK13	O15264	365 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RHOBTB3	O94955	611 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCNE1	P24864	410 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COPB2	P35606	906 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCR3	P51677	355 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DSG1	Q02413	1049 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ITGA9	Q13797	1035 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GCKR	Q14397	625 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC18A3	Q16572	532 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CROCCP2	Q86T23	111 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GLG1	Q92896	1179 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SNX24	Q9Y343	169 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DCC	P43146	1447 aa		9.36	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBPF26	B4DH59	902 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PFAS	O15067	1338 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GPAA1	O43292	621 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	OPHN1	O60890	802 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDE5A	O76074	875 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STX2	P32856	288 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PDE1B	Q01064	536 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRM2	Q14416	872 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694		Q6ZNX1	250 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ACAD11	Q709F0	780 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UNC13D	Q70J99	1090 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C14orf80	Q86SX3	495 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MAML3	Q96JK9	1138 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STK33	Q9BYT3	514 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EBF3	Q9H4W6	596 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP40	Q9NVE5	1235 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TIMM22	Q9Y584	194 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYPN	Q86TC9	1320 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694		E9PBE3	544 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPTLC1	O15269	473 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EXOC3	O60645	756 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADAMTS2	O95450	1211 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BMP15	O95972	392 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SERPING1	P05155	500 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CRABP2	P29373	138 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RXRG	P48443	463 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DR1	Q01658	176 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CDC16	Q13042	620 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BBS5	Q8N3I7	341 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPOCK2	Q92563	424 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C8orf37	Q96NL8	207 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		9.35	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MYH4	Q9Y623	1939 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GSC2	O15499	205 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DCTN3	O75935	186 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PGM3	O95394	542 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BRAF	P15056	766 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	XBP1	P17861	261 aa		9.34	□□□□□ -0.91
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AMPD1	P23109	780 aa		9.34	□□□□□ -0.91

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