RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CD302	Q8IX05	232 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	OPTN	Q96CV9	577 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	DPPA5	A6NC42	116 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	LDHC	P07864	332 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	PLS3	P13797	630 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	WDR78	Q5VTH9	848 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MGRN1	O60291	552 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	SLC9A1	P19634	815 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	IRX4	P78413	519 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	USP4	Q13107	963 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CARD9	Q9H257	536 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	EPHB6	O15197	1021 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CALB2	P22676	271 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	BTK	Q06187	659 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	JDP2	Q8WYK2	163 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MIS12	Q9H081	205 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	SNX3	O60493	162 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	EPHB2	P29323	1055 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	ARFIP2	P53365	341 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	KDSR	Q06136	332 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	RNF220	Q5VTB9	566 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	GOLGA8R	I6L899	631 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	GALNT17	Q6IS24	598 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	12.97	□□□□□ -0.33	1e-6	■■■□□ 15.4
PXN-222	ENST00000637624	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	PYGL	P06737	847 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	FLT3	P36888	993 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	AP2B1	P63010	937 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CDK17	Q00537	523 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MED21	Q13503	144 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	FIGN	Q5HY92	759 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	MREG	Q8N565	214 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	STK32A	Q8WU08	396 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	RFFL	Q8WZ73	363 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	COA7	Q96BR5	231 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	FAM210A	Q96ND0	272 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	ZNF263	O14978	683 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	ENTPD5	O75356	428 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	ZWINT	O95229	277 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CBX6	O95503	412 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	GSTA2	P09210	222 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	COASY	Q13057	564 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	CCDC89	Q8N998	374 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PXN-222	ENST00000637624	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms