RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	DAPK3	O43293	454 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	EDNRB	P24530	442 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	SLC16A1	P53985	500 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	EPHB4	P54760	987 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	LGI4	Q8N135	537 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	IPP	Q9Y573	584 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATRX-223	ENST00000637175	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PHF2	O75151	1096 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	TOX4	O94842	621 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	IL33	O95760	270 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	CYP2C19	P33261	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SEPT2	Q15019	361 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175		Q6ZVL8	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	RELT	Q969Z4	430 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	B4GALT4	O60513	344 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	POU2F2	P09086	479 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SLC6A9	P48067	706 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	BPIFB4	P59827	614 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PPP2CB	P62714	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	PPP2CA	P67775	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	DUSP8	Q13202	625 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	MLC1	Q15049	377 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	SURF1	Q15526	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATRX-223	ENST00000637175	MIER2	Q8N344	545 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms