RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.06■□□□□ 0.8
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CLN8-211ENST00000636934 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.06■□□□□ 0.8
CLN8-211ENST00000636934 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.06■□□□□ 0.8
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CLN8-211ENST00000636934 CYP2C19P33261 490 aa20.03■□□□□ 0.8
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CLN8-211ENST00000636934 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.03■□□□□ 0.8
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CLN8-211ENST00000636934 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.02■□□□□ 0.8
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CLN8-211ENST00000636934 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-211ENST00000636934 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
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CLN8-211ENST00000636934 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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CLN8-211ENST00000636934 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-211ENST00000636934 GPD1LQ8N335 351 aa20.01■□□□□ 0.79
CLN8-211ENST00000636934 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.01■□□□□ 0.79
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