RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	FZD1	Q9UP38	647 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	TULP2	O00295	520 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	ZEB2	O60315	1214 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	PPFIA4	O75335	1185 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	CCNE2	O96020	404 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	VCAM1	P19320	739 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	PPAT	Q06203	517 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD62	A6NC57	917 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	ADRB2	P07550	413 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	CCT5	P48643	541 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	MXI1	P50539	228 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	FAM84A	Q96KN4	292 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	RIPK3	Q9Y572	518 aa		14.16	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	SGPL1	O95470	568 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	HSD17B3	P37058	310 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	KIF22	Q14807	665 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	ALG3	Q92685	438 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC188	H7C350	402 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	CYP26A1	O43174	497 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	MREG	Q8N565	214 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	LPAR1	Q92633	364 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	ALG6	Q9Y672	507 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	NCAN	O14594	1321 aa		14.15	□□□□□ -0.14
BRF1-222	ENST00000635152	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ADSS	P30520	456 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2B	Q00403	316 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	GUCY1A3	Q02108	690 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	CUL1	Q13616	776 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	GLG1	Q92896	1179 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ATG4C	Q96DT6	458 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	GRIN2D	O15399	1336 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	MARCKSL1	P49006	195 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	PSMC5	P62195	406 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	LLGL1	Q15334	1064 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	EPC2	Q52LR7	807 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	JDP2	Q8WYK2	163 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	KRT35	Q92764	455 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	TEPSIN	Q96N21	525 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	14.14	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	WDR64	B1ANS9	1081 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K10	Q02779	954 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	MYBPC2	Q14324	1141 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	MESD	Q14696	234 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ANO5	Q75V66	913 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA4D	Q92854	862 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD6	Q96KE9	485 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	PXMP2	Q9NR77	195 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	DENND3	A2RUS2	1198 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	CNGA1	P29973	690 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	NPTX2	P47972	431 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	ALCAM	Q13740	583 aa		14.13	□□□□□ -0.15
BRF1-222	ENST00000635152	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms