RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	TSG101	Q99816	390 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	AHCYL1	O43865	530 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CCND2	P30279	289 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SLC7A5	Q01650	507 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PLS1	Q14651	629 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CENPT	Q96BT3	561 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	REEP2	Q9BRK0	252 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PTPRF	P10586	1907 aa		16.57	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CXCL11	O14625	94 aa		16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CUL1	Q13616	776 aa		16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ITIH4	Q14624	930 aa		16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		16.56	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RCCD1	A6NED2	376 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PJA2	O43164	708 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FES	P07332	822 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NR3C2	P08235	984 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NEFH	P12036	1026 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PPP2R2A	P63151	447 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MOB2	Q70IA6	237 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	OTUD5	Q96G74	571 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NFU1	Q9UMS0	254 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PLAA	Q9Y263	795 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	IRF6	O14896	467 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	GRIN3B	O60391	1043 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TNNC1	P63316	161 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LBX2	Q6XYB7	198 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TEX9	Q8N6V9	391 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC63	Q8NA47	563 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CHST13	Q8NET6	341 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LXN	Q9BS40	222 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		16.55	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ABLIM1	O14639	778 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ALAD	P13716	330 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	NLRX1	Q86UT6	975 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SFR1	Q86XK3	245 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	GPRASP2	Q96D09	838 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		16.54	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	SCN4A	P35499	1836 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	CES2	O00748	559 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ZBTB39	O15060	712 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	GAP43	P17677	238 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	GUCY2D	Q02846	1103 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	MYO1E	Q12965	1108 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	PPIL2	Q13356	520 aa		16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24
BBS1-225	ENST00000630659	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24

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