RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614198.4

GGA3-221, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 3,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-221	ENST00000614198	PFAS	O15067	1338 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	LRRN2	O75325	713 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MYL1	P05976	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MYBL2	P10244	700 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PEX3	P56589	373 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MIIP	Q5JXC2	388 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ARMCX2	Q7L311	632 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	KCTD16	Q68DU8	428 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CEP57	Q86XR8	500 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GGA2	Q9UJY4	613 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	RASSF10	A6NK89	507 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	TGFB1I1	O43294	461 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	EDNRB	P24530	442 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PSMC5	P62195	406 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	DPP9	Q86TI2	863 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198		A0A1B0GUA9	196 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	RGMB	Q6NW40	437 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PLXNB2	O15031	1838 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	KLHL33	A6NCF5	533 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SLC25A27	O95847	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GYPC	P04921	128 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	KRT76	Q01546	638 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ADAM9	Q13443	819 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CYP2B6	P20813	491 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CYP2J2	P51589	502 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CRHR2	Q13324	411 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	IWS1	Q96ST2	819 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198		K7ENM7	598 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	AKAP3	O75969	853 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	NR2F2	P24468	414 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CDR1	P51861	262 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	IGBP1	P78318	339 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GRIK3	Q13003	919 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PDCL	Q13371	301 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		10.77	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		10.77	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		10.77	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.77	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		10.77	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ALS2CL	Q60I27	953 aa		10.77	□□□□□ -0.68
GGA3-221	ENST00000614198	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68

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