RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 TMX3Q96JJ7 454 aa21.29■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.29■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.29■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.29■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 TBX10O75333 385 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 OFD1O75665 1012 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 14e-7■■■□□ 18.8
ANKRD54-211ENST00000609454 ARL2P36404 184 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 CAPSQ13938 189 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 NBR1Q14596 966 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC51Q96ER9 411 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 CPB2Q96IY4 423 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.28■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.28■■□□□ 1
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ANKRD54-211ENST00000609454 GLRA2P23416 452 aa21.27■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 GJB2P29033 226 aa21.27■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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ANKRD54-211ENST00000609454 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.27■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 APOL6Q9BWW8 343 aa21.27■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
ANKRD54-211ENST00000609454 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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ANKRD54-211ENST00000609454 CXCL14O95715 111 aa21.26■□□□□ 0.99
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ANKRD54-211ENST00000609454 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54-211ENST00000609454 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54-211ENST00000609454 PADI6Q6TGC4 694 aa21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54-211ENST00000609454 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54-211ENST00000609454 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.26■□□□□ 0.99
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ANKRD54-211ENST00000609454 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.26■□□□□ 0.99
ANKRD54-211ENST00000609454 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.26■□□□□ 0.99
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ANKRD54-211ENST00000609454 GLP2RO95838 553 aa21.22■□□□□ 0.99
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