RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC35C1Q96A29 364 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CCDC51Q96ER9 411 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FBXL18Q96ME1 805 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAP7D2Q96T17 732 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPC25Q9HBM1 224 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.85□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A1W2PQJ5 194 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TISP43B9A030 160 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ADAMTS4O75173 837 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ELNP15502 786 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FECHP22830 423 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KLRC1P26715 233 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CNGA1P29973 690 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PHKA2P46019 1235 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KCNJ6P48051 423 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CASP4P49662 377 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LIG4P49917 911 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PTENP60484 403 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGBP1P78318 339 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CCZ1BP86790 482 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BFSP1Q12934 665 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SYCP1Q15431 976 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF410Q86VK4 478 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TC2NQ8N9U0 490 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RNF149Q8NC42 400 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BICD1Q96G01 975 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NUP58Q9BVL2 599 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HTTP42858 3142 aa9.84□□□□□ -0.83
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MYADML2A6NDP7 307 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 K7ERI5 159 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZEB2O60315 1214 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MSCO60682 206 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EDN1P05305 212 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRKCBP05771 671 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ADRB2P07550 413 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MYL3P08590 195 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KRT13P13646 458 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ADSSP30520 456 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ADAM17P78536 824 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BEX3Q00994 111 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LRMPQ12912 555 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIM32Q13049 653 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ARID5BQ14865 1188 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAPK6Q16659 721 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PTPN21Q16825 1174 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM187BQ17R55 369 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GPD1LQ8N335 351 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 METTL13Q8N6R0 699 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAET1EQ8TD07 263 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NLRP4Q96MN2 994 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PANX2Q96RD6 677 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.83□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ESPNB1AK53 854 aa9.82□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PMM2O15305 246 aa9.82□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EXTL3O43909 919 aa9.82□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TOM1L1O75674 476 aa9.82□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PROZP22891 400 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms