RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SFNP31947 248 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NPTX2P47972 431 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GUCY2FP51841 1108 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNNC1P63316 161 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRKG1Q13976 671 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DCAF15Q66K64 600 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP170P1Q96L14 293 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC172P0C7W6 258 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADSSP30520 456 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCKAP1LP55160 1127 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EMBQ6PCB8 327 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PACS2Q86VP3 889 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BSNDQ8WZ55 320 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF862O60290 1169 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM253P0C7T8 217 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EPC2Q52LR7 807 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AGPAT1Q99943 283 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TBX20Q9UMR3 447 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DENND3A2RUS2 1198 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MXI1P50539 228 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF22Q14807 665 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 REPS2Q8NFH8 660 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RFFLQ8WZ73 363 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACP6Q9NPH0 428 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RGS20O76081 388 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNFRSF8P28908 595 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AMFRQ9UKV5 643 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CES2O00748 559 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ITGA4P13612 1032 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMTNP53814 917 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCFD2Q8WU76 684 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CAVIN3Q969G5 261 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRIT1O00522 736 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNGA1P29973 690 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PAK2Q13177 524 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SEMA4DQ92854 862 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TIPINQ9BVW5 301 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COG5Q9UP83 839 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCANO14594 1321 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP8B3O60423 1300 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNA2P16389 499 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DSG3P32926 999 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CORO7P57737 925 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HES6Q96HZ4 224 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM84AQ96KN4 292 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IWS1Q96ST2 819 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PEX10O60683 326 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SGPL1O95470 568 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NAA35Q5VZE5 725 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ICE2Q659A1 982 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPRASP2Q96D09 838 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FZD9O00144 591 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FTLP02792 175 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FDX1P10109 184 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RFX1P22670 979 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PNMA2Q9UL42 364 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms