RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 PNMA1Q8ND90 353 aa13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PHKBQ93100 1093 aa13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PANK2Q9BZ23 570 aa13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 SMOC1Q9H4F8 434 aa13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 STK39Q9UEW8 545 aa13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 DPP7Q9UHL4 492 aa13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 ACACAQ13085 2346 aa13.3□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 SPAG17Q6Q759 2223 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 FSHRP23945 695 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 VPS53Q5VIR6 699 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 TCEAL6Q6IPX3 200 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 RNF169Q8NCN4 708 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 TCEAL3Q969E4 200 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 GPRASP2Q96D09 838 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 RPS6KC1Q96S38 1066 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 KXD1Q9BQD3 176 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 EDEM2Q9BV94 578 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PHF20Q9BVI0 1012 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 ECHDC1Q9NTX5 307 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D13Q9NVG8 400 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 DNAJB4Q9UDY4 337 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa13.29□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 CACNA1EQ15878 2313 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PTPN13Q12923 2485 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 FAM221BA6H8Z2 402 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB5O15062 677 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 AXIN1O15169 862 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 EFEMP2O95967 443 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 C1RP00736 705 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 MYBP10242 640 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 CXCL12P48061 93 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 C19orf57Q0VDD7 668 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 DGKHQ86XP1 1220 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 DNASE1L2Q92874 299 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 FGF13Q92913 245 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R16BQ96T49 567 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 PIDD1Q9HB75 910 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 RXFP1Q9HBX9 757 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 TOMM22Q9NS69 142 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 DOCK6Q96HP0 2047 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 ASXL3Q9C0F0 2248 aa13.28□□□□□ -0.28
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SOD2P04179 222 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PRB1P04280 392 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 KLRC1P26715 233 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 HOXA6P31267 233 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 MPLP40238 635 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SLC35G1Q2M3R5 365 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 CEP68Q76N32 757 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 WDR5BQ86VZ2 330 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 VAT1LQ9HCJ6 419 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 WDR81Q562E7 1941 aa13.27□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 C4orf47A7E2U8 309 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 URODP06132 367 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ITGB5P18084 799 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 HOXC13P31276 330 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ALX1Q15699 326 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 NLRX1Q86UT6 975 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 SPEM1Q8N4L4 309 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 VPS45Q9NRW7 570 aa13.26□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 COL1A2P08123 1366 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ZMYM6O95789 1325 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 C22orf31O95567 290 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 CHRNB1P11230 501 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 AK2P54819 239 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 NTHL1P78549 312 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 LILRA6Q6PI73 481 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 NPAS3Q8IXF0 933 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 CDHR1Q96JP9 859 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 AZI2Q9H6S1 392 aa13.25□□□□□ -0.29
HCG18-241ENST00000602290 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms